Recordé que en otras ocasiones había realizado la instalación desde consola. Cuando busco información me encuentro que en las nuevas versiones de Magento (1,5 en adelante), en lugar de usar el comando ./pear, se usa el comando ./mage.
Si observas el directorio raíz de la instalación de magento verás que hay un archivo con ese nombre "mage", ahora deberás establecer sus permisos a 550 y el propietario al propietario del sitio (apache:apache, nobody:nobody, etc...).
Una vez hecho esto comprobamos que funciona ejecutando ./mage nos tendrá que aparecer todas las opciones del comando.
Bien pues para instalar la extensión tendremos que ejecutar el comando de la siguiente manera:
./mage install http://connect20.magentocommerce.com/community nombre_extension
Ojo, fíjate que no es exactamente la Clave de instalación, hay un espacio entre el nombre del Canal y el nombre de la extensión. En la clave de instalación que proporciona la página de extensiones de Magento esto viene todo seguido.